Мөөгөнцрийн халдвар нь ихэвчлэн бие махбодид байдаг бичил биетний энгийн тэнцвэргүй байдлаас үүсдэг.

Энэ нь үнэн хэрэгтээ олон төрлийн мөөгөнцөр, бактериар колоничлогдсон байдаг бөгөөд ихэнх тохиолдолд хор хөнөөлгүй, тэр ч байтугай биеийн хэвийн үйл ажиллагаанд зайлшгүй шаардлагатай байдаг.

Гэсэн хэдий ч эдгээр мөөгөнцөрийн зарим нь үржиж, эмгэг төрүүлэгч болох эсвэл амьтнаас халдварладаг "гадны" мөөгөнцөр нь халдвар үүсгэдэг. Нийтдээ 200-400 төрлийн мөөгөнцөр хүнд өвчин үүсгэдэг⁵.

Гэсэн хэдий ч хүрээлэн буй орчинд байгаа мөөгөнцөр нь хүнийг бохирдуулдаг, жишээлбэл:

• тарих замаар, жишээлбэл, гэмтлийн үед (споротрихоз эсвэл хромомикоз гэх мэт);
• хөгц мөөгөнцөр (гистоплазмоз, апергиллез гэх мэт) амьсгалах замаар;
• халдвартай хүнтэй харьцах (кандидоз, цагираган хорхой гэх мэт);
• халдвар авсан амьтантай харьцах замаар.